Hola
Probablemente sólo has actualizado los archivos, pero te falta un paso más. Si te descargas el pack de actualización de la web de phpbb, viene un archivo llamado update_to_latest.php, que debes subir a tu servidor en [Ruta del phpBB]/install/update_to_latest.php y ejecutarlo desde el navegador. Eso te actualizará la base de datos (que no la tenías actualizada) y desaparecerá el error.
Suerte
