Bueno eso que decias de correr un programa... Se puede hacer (aunque no se deberia poder) por un error de ActiveX de MS IE, busca en datafull.com, en la seccion datahack, ahi esta explicado.
De todos modos si haces un link a un archivo haciendo
<a href="file://C:/dir/file.exe"> File </a>
supongo que al clikear corre, aunq no lo probe.. Intenta nada más,
Saludos
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