Hola:
Se puede obtener del array elements de un formulario, todos los input de type=checkbox y ponerle el estado deseado:
function todos(f, estado) {
eles = f.elements;
for (var i = 0, total = eles.length; i < total; i ++)
if (eles[i].type == "checkbox")
eles[i].checked = estado;
}
Saludos
