Lo mejor es que revises en el informe de estado de configuración de PHP que se emite usando:
Código PHP:
<?
phpinfo():
?>
Ahí veras en el primer bloque de información .. la ruta hacia tu php.ini en el apartado correspondiente (no recuerdo el nombre textual .. pero ya veras ahí un "php.ini" mencionado).
Ese es el "php.ini" que realmente está usando PHP en ese momento .. fuera que "por defecto" esté o suela estar en tal directorio de la instalación de PHP ..
Por ejemplo .. en Linux depende de la distribución que uses ..
En Windows suele estar o debería estar en: windows\
En el mismo informe que arroja "phpinfo()" veras un bloque de información referente a GD sobre su configuración y versión que tengas instalada si es que la tienes instalada. Ese es el dato que manda más que lo que diga tu php.ini .. por qué es ahí donde se informa que se está "usando" realmente y funciona.
Un saludo,