tienes que mirar dos cosas.
vete a:
Site -> Manage Sites
escojes el site con el que tienes problemas y dale a 'Edit'.
1- En la seccion de 'Local Info', en el encasillado que dice 'HTTP Address' asegurate que tengas la ruta relativa a tu localhost:
http://localhost/carpeta/
siendo carpeta la carpeta donde se encuentra tu site. Lo mejor es guardar los sites en carpetas ya que asi puedes desarrollar varios sites en tu localhost.
2- En la seccion de 'Testing Server', en el encasillado de 'URL prefix' debes tener lo mismo:
http://localhost/carpeta/
me dices si te sirvio de algo.
Saludos.