Hola:
Sí, son los popups y se generan con window.open("popup.html")... si lo quieres de forma automática, puedes ponerlo en el body: <body onload="window.open(...)"
Pero en mi opinión es muy molesto que se abren ventanas automáticamente y los matapopups los anularían fácilmente... te sugiero que hagas otra cosa como un rotador de banners.
Saludos