Según lo que entendí quieres incluir en cada página de tu sitio una línea parecida a esata no:
Código HTML:
<link href="hoja.css" type="text/css" rel="stylesheet"/>
Eso lo puedes lograr usando la herramienta de búsqueda de dreamweaver, y en la lista seleccionar "Sustituir en todos los archivos del sitio local".
La búsqueda que harías sería algo como:
Y la sustitución sería:
Código:
<link href="hoja.css" type="text/css" rel="stylesheet"/>
</head>
Recuerda de colocar correctamente el nombre de la hoja de estilos.
Saludos