No creo que ese sea el problema .. más bien de cabeceras HTTP envidas antes en tu script antes de tus "header()" que enviará el código que uses para geneerar el thumbnail "on-the-fly" (al vuelo).
Tal vez pueda ser un simple espacio antes de <? (de inicio de PHP) .. o un salto de línea .. En otros casos otro tipo de error que PHP originie su salida (que en condiciones normales lo verías en tu navegador) .. origina ese efecto ..
Consejos para evaluar ese tipo de problemas:
1) Verfica el tema de "espacios" y "saltos de línea" antes del inico de código PHP <? .. (y otro tipo de salida HTML en general al cliente ...)
2) Ejecuta tu script que genera la imagen en forma individual ..
Supongo que tendrás algo tipo: genera_thumbnail.php?parametro=valores a lo sumo y eso lo llamas en otros scripts a la hora de verlos por un <img src="genera_thumbnail.php?parametro=valores">
En ese caso .. llama a tu script de generación de thumbnail por tu navegador en forma individual.
3) Quita (comenta // ) las líneas donde hagas uso de "header()", así es probable que veas algún mensaje de error que el envio de cabecers HTTP oculta.
No obstante el código que usas tal cual ayudaría a ver otro tipo de problemas .. o recomendaciones (para "forzar" ver algún mensaje de error).
Un saludo,