Creo que un curso especificamente para modificar plantillas está dificil de conseguir pues cada plantilla es distinta y cada cliente quiere tener un resultado final distinto. No hay un procedimiento definido para modificarlas.
Me parece que si se trata de una plantilla en flash y tienes conocimiento en flash entonces no necesitas nada más pues lo único que debes hacer es modificar los symbols para que se adapten a tu diseño y manipular el timeline y el código actionscript de los eventos para que hagan lo que tu quieres.
De la misma forma puedes usar Photoshop para manipular las imágenes a tu gusto y obtener el resultado final que desees.
Me parece que en ambos casos necesitarás saber algo de HTML. Puedes encontrar muchos tutoriales en
http://abcdatos.com/.
Espero te sirva, un saludo!