Hola:
Los enlaces se hacen con etiquetas "a"... y en el caso de iframes (o frames o ventanas) un target que indique el destino, pero en tu pregunta original decías de modificar otras cosas de la página (mira tu mensaje original)...
Por ejemplo, si quieres que en un enlace se cargue en el iframe la página destino.html, y a la vez se oculte la capa con id="ocultarme"
...entonces sería algo así:
<a href="destino.html" target="zona" onclick="document.getElementById('ocultarme').styl e.display = 'none'" >...</a>
Saludos