Hola!!
De todas formas, no es necesario utilizar flash para visualizar los videos, salvo que tu site esté hecha en flash.
en caso contrario, puedes probar a hacerlo a traves de Streaming.
Código HTML:
<object id="MediaPlayer" width="208" height="227" classid="CLSID:22D6f312-B0F6-11D0-94AB-0080C74C7E95" standby="Loading Windows Media Player components..." type="application/x-oleobject">
<param name="FileName" value="../video/<?php echo $_GET['mostrar']; ?>">
<param name="ShowControls" value="true">
<param name="ShowStatusBar" value="true">
<param name="ShowDisplay" value="false">
<param name="autostart" value="true">
<embed type="application/x-mplayer2" src="../video/VIDEO A MOSTRAR"
width="208" height="227" showcontrols="1" showstatusbar="1" showdisplay="0" autostart="1">
</embed></object>
Por medio de este código se visualiza un pequeño reproductor windows media en tu web.
Espero que te sirva.
Un saludo