Primero averigua qué drivers están soportados por tu versión de mplayer:
Luego ejecuta mplayer usando ese driver. Por ejemplo, para usar el driver x11:
Código:
mplayer -vo x11 /archivo/que/quieras/ver.avi
Si usas alguna interfaz gráfica como GMplayer o KPlayer, es cosa de mirar las preferencias de dicha aplicación. O puedes editar tu archivo ~/.mplayer/config y fijar las opciones por defecto.
Más info en el manual de mplayer ("man mplayer") y en la web oficial (busca en Google).