Si esta hecho en Flash, y no llama ningún swf externo, sí se puede...
Lo que te recomiendo es que uses el Zinc Load (no es free) para encapsular el exe de Flas y que no pueda ser decomplilado, luego ese otro exe resultante meterlo por el TZ Copy Protect (este sí es free), y entonces sí, seguridad total, no puede ser decompilado ni copiado.
Así hago con mis proyectos multimedia CD-Learning y funciona a las mil maravillas.
Por cierto, bienvenido al foro y... procura no repetir el mismo post en diferentes foros, luego te los borran.
http://www.forosdelweb.com/f16/encriptar-flash-405236/