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Yo creo que lo mejor para pasar datos en array es usar JSON (Javascript Object Notation) tienes un tutorial ac'a:
http://www.json.org/js.html
con esto puedes serializar tu array y para parsearlo en el servidor en este PHP
http://freshmeat.net/projects/json_php_package/
si pasas de esto puedes pasarle al servidor un XML y parsearlo, es lo mismo.
la era de los string separados por comas simulando un array pas'o a la historia.
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