Sería posible que al no haber establecido un Doctype en tu web I.E. no interprete de manera correcta los estandares CSS que le indicas (sobreto en cuanto a los puntos de referencia que navegadores problemáticos, al margen de un Doctype definido, autoasignan para ciertos atributos como margin, padding, border, etc...) y por ello si visualizas la web en dicho navegador el resultado es incorrecto; ya que no es capáz de dibujar, de manera correcta, el modelo de bloques.
Así ve el modelo de bloque el IE cuando no detecta un Doctype estandar que le explique que así no va la cosa:
Y este es el modelo correcto según el estandar:
PD: Estoy muy bajo de moral últimamente y la cita de tu firma me dio algo de esperanza, gracias.