Basta con que pongas orden en los nombres de los marcos para que se confundan:
un ejemplo:
tu página index contiene:
[superior_todo]
[izquierda_todo]
[contenido_todo]
y esa página que se abre en el principal ([contenido_todo]) del index puede tener:
[superior_segunda]
[contenido_segunda]
De esta forma, los links de la izquierda ([izquierda_todo]) apuntan a [contenido_todo] y los links de la parte superior de la página que se abre en ese contenido_todo apuntan a [contenido_segunda].
espero que no haberlo puesto muy lioso...