Si ya está todo funcionando debes bajarte algunos programas que te ayudarán a manejar el servidor de mejor manera.
Mysql Administrator (
http://dev.mysql.com/downloads/administrator/1.1.html) te permitirá manejar el servidor, crear bd y tablas, realizar backups, etc.
Mysql Query Browser (
http://dev.mysql.com/downloads/query-browser/1.1.html) te permite realizar consultas, ejecutar scripts.