en el evento de tu checkBox podrías adicionar el siguiente código:
 
Código:
 string jscript = "<script language='javascript' type= 'text/javascript'> window.open('mipagina','','toolbar = 1,scrollbars = 1, width = 800, height = 600, top = 0, left =0 ');</" + "script>";
        ClientScript.RegisterClientScriptBlock(this.GetType(), "TituloScript", jscript);
  o si quieres que sea sin PostBack, puedes llamar a la función declarada previamente en un página que acepte un parámetro con el nombre de la pagina y haces el siguiente código:  
Código:
 MiCheckbox.Attributes.Add("onclick","AbrePopUp('nombreDeMiPagina')");
  saludos