Hola qué tal,
el tema es que debes haberlo ajustado todo en base a cómo te iba quedando en IExplorer. Este navegador interpreta las cosas de forma no acorde a lo estándares. Por eso cuando lo ves en otro navegador lo ves diferente.
Deberías revisar tu css para que se vea primero correcto en un navegador con correcto soporte css y luego pulir el código hasta lograr obtener el mismo resultado en IExplorer.
Un saludo
