Usa la directiva:
$DOCUMENT_ROOT
asi tus phats se quedarian en
$DOCUMENT_ROOT\otrodir\elscript.php
pd: ... mirate el capitulo 7 (Variables predefinidas) del manual de PHP oficial: <a href='ir.asp?http://www.php.net/manual/es' target='_blank'>www.php.net/manual/es...</a>
Un saludo,