DW 8 me duplica ecódifo js

[X3mdesign]

Hola foro!!!

Estoy haciendo una web... y tengo un archivo js donde estoy metiendo el código que voy usando, pero cuando actualizo la plantilla(php.dwt) puesto que tiene imáganes con rollover y popUps, me coloca el código en las páginas que usan dicha plantilla, no sirve de nada borrarlo porque al volver a modificar la actualiza igualmente, y eso que el archivo js está correctamente linkado...

alguna sugerencia??