Lo malo de ponerlo en esa localizacion es que TODAS las aplicaciones que corran con esa JVM usaran ese driver, y SOLO las que corran con esa JVM. Asi que si un día ejecutas un programa que tenga que acceder a una BDD que necesite otro driver, casca. Si se actualiza la JVM y se le olvida a alguien copiar esa libreria en \jre\lib\ext, casca.
Yo normalmente nunca recomiendo usar esa solucion para el classpath, pero bueno, es personal. Se recomienda mucho por que es la forma más facil de hacerlo sin entender como funciona el classpath
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