Cuidado que jscript y javascript no son exactamente lo mismo. El primero es sólo par IE.
Sin ver el código fuente es dificil saber. Si no es muy largo el código ponlo aquí, pero sólo la parte que le llega al navegador (sin php). Si el código generado es muy largo entonces mejor ponlo en algún server para poder probarlo online y ver qué pasa.
un saludo