Hola Neuron, lo que yo haría es lo siguiente:
1. Crea el proyecto:
Archivo->Nuevo->Proyecto
En la ventana nueva selecciona el tipo de proyecto
Visual C# Projects en mi caso
Del lado derecho, selecciona el template
ASP.NET web application
Te va a pedir la localidad de este proyecto, para lo cual deberias haber creado un directorio virtual en tu IIS
http://localhost/directorio_virtual/...de_tu_proyecto
Despues de crearlo, deberias mover tus archivos a esta localidad...esto para un proyecto que ya esta hecho y quieres editar.
Si no es asi, selecciona crear proyecto en folder existente, con lo cual te va a crear lo que necesitas para correr tu aplicacion...
Ya que tengas eso, pues nada mas es ir al menu Build y compilar tu aplicacion...
Espero que te sirva!