abrir puerto 3306

[Hijacker]

Lo que hace que un puerto se ponga a la escucha que es lo que creo quieres decir, es que la propia aplicación funcione, esta aplicación es la que crea "ese puerto" para que se ponga a la espera de recibir alguna conexión externa dirigida a ese puerto en concreto, es decir, que si tu mysql en windows 2000 está bien instalado y bien configurado, y sabes a conciencia según el manual de instalación y/o configuración de esa versión de mysql o sabes porque en iana.org el puerto de mysql asignado es el que haces referencia que es el 3306, al hacer un netstat -noa te tendría que aparecer como LISTENING ya sea UDP o TCP, A NO SER QUE TENGAS ALGÚN FIREWALL INTERMEDIO, en ese caso tendrás que abrir el puerto para que no intercepte las conexiones dirigidas al puerto 3306.