tu phpmyadmin tiene opcion de importar csv, lo unico que tienes que hacer es guardar tu excel en csv separado por comas, con eso deberia solucionarse el problema de toda manera lo guardas como txt, y lo puedes importar con LOAD DATA INFILE desde mysql
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/load-data.html
saludos... cya