nod32 la version 2.51 es totalmente compatible con windows server 2003, mc afee creo que tambien, pero el nod32 si lo es, lo he probado y funciona...
en firewall, date una vuelta por el foro de virus troyanos en la parte de seguridad, hay un buen topic en donde se explica detalladamente sobre seguridad en servidores.
aca te dejo el enlace:
http://www.forosdelweb.com/f66/que-firewall-recomiendan-387719/
saludos