Hola:
Leete esto, está lo necesario y lo del fichero de manifiesto.
http://www.chuidiang.com/java/novatos/HacerJar.html
De todas formas, tu última opción es la buena, pero si pones
jar c
mf
debes poner
primero el manifiesto y luego el jar. Si pones
jar c
fm
entonces va
primero el jar y luego el manifiesto. Es decir, el orden de las opciones "m" y "f" determinan si va primero el manifiesto o el jar ...
Se bueno.