El AGP Aperture Size es para indicar cuanta memoria principal se puede dedicar a tareas gráficas.
(más explicado
aquí).
Mi formula personal es un valor entre la mitad de la RAM (sistema) y el doble de la VRAM (tarjeta de video)
Sobre combinar memorias de diferentes velocidades EN TEORIA no hay problema, aunque en la práctica no siempre es tan buena idea. La teoría dice que la PC133 se bajaría a trabajar a PC100 y tendrás tus 384MB; en la práctica la RAM más rápida no funciona o se reconoce a la mitad de su capacidad.