Webmin
http://www.webmin.com
Es uno de los gratuitos mas conocidos, con muchos modulos configurable al 100%.
VHCS
http://vhcs.net
Una gran diseño, funcionalidad.
Ferozo
http://ferozo.net
Por el momento te regalan la licencia por un año, parece ser un buen sistema.
Si encuentro otros se los hare saber.
