Y sobretodo... ¿cuál es el problema?. Tu pregunta es solo "dónde hacer modificaciones", pués bien, en un archivo .css dentro del directorio themes/...
Sino entendí mal, estás usando una aplicación prefabricada llamada ATutor:
http://www.atutor.ca/
Igual.. tienes diferentes themes para descargar en el sitio oficial:
http://atutor.ca/atutor/themes/index.php
Si vaz a crear personalizar tu tema desde el inicio, lo mejor es que te leas algún tutorial de CSS; va a ser compllicado ayudarte si partes de cero.
Saludos y suerte!