Si estas trabajando con aplicaciones por consola . Siento decirte que ya estuve buscando lo mismo que tú , un clrscr o algo similar y no lo encontré .
Intenta hacer la aplicación en un contenedor gráfico ( swing ) , de esa manera si tienes control absoluto , o casi , de la pantalla
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Por cierto se me olvidó comentarte que se nota que vienes de el Pascal

( clrscr; gotoxy(i,j); ...) . Una Pena que no haya foro de Delphi y/o Pascal object en FDW