Tienes que particionar tu disco duro, crear una partición para el Windows y otra para Linux.
-Si vas a instalar ambos SO, primero particionas, luego instalas primero el Windows y por último tu distribución de GNU/Linux.
-Si no vas a instalar el Windows porque ya tienes archivos y configuraciones que no quieres perder o reemplazar; está un poquitín difícil, tendrás que redimensionar la partición existente para dejar espacio no particionado, luego lo formateas en formato Ext3 que es el formato de Linux, bueno, primero creas la partición
. Los discos de GNU/Linux traén para formatear y redimensionar. Antes de redimensionar, debes defragmentar el disco para evitarte perder datos, o mejor aún si tienes grabadora, pues has tu copia de archivos para no tener experiencia de mal gusto.
Yo esto lo hago fácil con un par de disquets que te puedo pasar.
Revisa las FAQs cómo dice el amigo arriba.