Más datos, por favor....
Cuál Sistema Operativo tienes instalado?
Si es Windows XP, prueba iniciando con el CD de instalación, entra a modo de recuperación, y en el símbolo de sistema, teclea
CHKDSK C: /P /R
Ojo: con la variable C:, sólo estás indicando hacer un diagnóstico de la unidad C:, pero después de terminado, repite el comando cambiando la unidad por las siguientes: D: y E: