Todo depende del destino de esos CDs, si por ejemplo es para evitar que los puedan usar , un soft muy bueno es el "CryptCD" ,
http://www.cryptcd.com/ lo que hace es que para ejecutar el CD debes introducir una clave, por lo que no importa si lo copian, sin la clave no pueden hacer nada,esto evidentemente no sirve si tus intenciones son las de comercializar los CD. Para esto último podés usar el "TZCopyProtection" , es gratuito , no será una garantía total, pero por lo menos creo que deja fuera del alcance de los piratas de agua dulce que son la gran mayoría.
http://www.pandreonline.com/tzcopy/