Usa la que sea más conocida en tu ambiente.
Ahora, si me preguntas MI opinión personal y privada (
), te recomiendo CentOS, por varias razones:
1. Está pensada para ser usada en servidores de producción. Por ello tiene ciclos de vida largos y excelente soporte para actualizaciones y bug-fixes.
2. Es un clon de Red Hat Enterprise Linux, por lo que toda la
documentación oficial de Red Hat te servirá.
3. Red Hat es sin duda la distro más usada en servidores y ambientes corporativos, por lo que te será mucho más fácil encontrar ayuda en foros, listas de correo y comunidades de usuarios.
Aunque repito: lo mejor es que uses la distro que sea más conocida en tu ambiente.