Todo es cuestion de si utilizaste ubicación relativa o explicita. Por ej.
aplicacion principal en raiz: si no has indicado otra cosa en el directorio que la pongas ese sera el directorio raiz.
Ahora si indicaste
http://www....... entonces deberias reescribir el codigo.
Saludos y utiliza url relativas.
PD. no entiendo que tiene que ver con apache, creo que estaría mas en php.