Te sugiero que leas la documentacion de FPDF y como lo tienes configurado en mis casos tengo algo como lo siguiente en el archivo comunes.php donde esta el Header y el Footer
Código PHP:
//Pie de página
function Footer()
{
global $montos;
if ($montos == "1") {
$this->SetY(-18);
$this->SetFillColor(255,255,255);
$this->SetFont('Arial','',5);
$this->Cell(50,6,'Nota: montos excluyen el IVA','',0,'L',0);
}
//Posición: a 1,5 cm del final
$this->SetY(-10);
//Arial italic 8
$this->SetFont('Arial','',8);
//Número de página
$this->Cell(0,10,'-- '.$this->PageNo().' --',0,0,'C');
}
Revisa como estas haciendo para lanzar una pagina nueva.... tienes $pdf->AddPage(); ? cuando llegas a un numero determinado de lineas de impresion ?
Saludos
Frank