Todo depende de las version de mysql que estes usando ya que MySQL soporta transacciones desde la version 3.23.34b si no mal recuerdo y puedes hacer uso del COMMIT, BEGIN, ROLLBACK, soporta integridad referencial en las tablas innodb y ademas puedes cambiar el nivel de aislamiento(READ UNCOMMITTED | READ COMMITTED | REPEATABLE READ | SERIALIZABLE ). Dependiendo de lo que necesites.
Para hacer uso de ellas baja la version mas reciente del source de Mysql o los rpm de mysql y mysql-max.
Para mas detalles lee el capitulo 7 del manual de MySQL.
<a href='ir.asp?http://www.mysql.com/doc/I/n/InnoDB.html' target='_blank'>http://www.mysql.com/doc/I/n/InnoDB.html...</a>
<a href='ir.asp?http://www.mysql.com/doc/B/D/BDB.html' target='_blank'>http://www.mysql.com/doc/B/D/BDB.html...</a>
Tambien lee este capitulo.
<a href='ir.asp?http://www.mysql.com/doc/C/O/COMMIT.html' target='_blank'>http://www.mysql.com/doc/C/O/COMMIT.html...</a>
Saludos!.
Mty. NL.