¿Qué aplicación prefabricada usas? ¿En qué lenguaje está tu sitio? Hay muchos rotadores de banners en internet, esos pueden servirte.
Pero hay CMS's como
Joomla que tienen la opción de rotar los banners, por eso te sugiero que nos comentes en qué hiciste tu sitio.
Slaouds, 