pues ya te lo han dicho generalmente con un software cualquiera que permita dividir por capas puedes
duplicar una capa bases y luego recortar las areas de los duplicados hasta dejar los sectores a los que probaras cambiar de color y posteriormente con las opcion que es ya standar Hue/Saturation cambia la valoracion tonal (sin marcar la opcion estandar colorize) y obsevaras como cambian los colores de cada layer al que se lo aplicas
Referencias que te pueden servir:
http://www.forosdelweb.com/f6/psp-cambio-colores-371839/