Cita: Donde debo propagar las sesiones? En cada uno de los marcos de forma independiente o en el marco contenedor?
En todos los marcos y frame-set que uses.
Recuerda que un "frame" se comporta como una página totalmente independiente .. así que como tal tendrá que tener sus respectivas autentificaciones y validaciones de las variables de sesión que uses. Imagina si accedes directo a cierta página que compone ese "frame-set" .. Observa que sucede si no incluyes tus rutinas de validación de sesiones.
Un saludo,