El programa es correcto, lo único que fflush(stdout) no le veo el sentido, quizás te refieras a fflush(stdin).
En cualquier caso, sobre lo de "controles" para windows/linux, no deberías tocarlos cuando estás aprendiendo C. No porque no sea bueno, sino por dos simples razones:
1. No tienes suficientes conocimientos de C como para entender como usar una GUI "a pelo" (es bastante complicado si nunca antes lo has hecho).
2. Te distrae del objetivo que es aprender C.
Pero no te voy a ocultar la respuesta:
Con esa línea tienes toda la API de Windows a tu disposición.
Es decir, este programa "tal cual está", mostraría una ventanita con el mensaje y ese título:
Código:
#include <windows.h>
int main()
{
MessageBox(NULL,"hola que tal","titulo",MB_OK);
return 0;
}