Que tal korrea27, mira, cuando hablas de .Net, estas hablando de todo un conjunto de tecnologías, muchas veces la gente habla de .Net refiriendoze a vb.net y otros piensan que asp.net es la nueva version de asp, en fin, en cuanto a tu pregunta, puedes seguir ocupando los ActiveX de tu VB6 sobre tu proyecto, pero te recomiendo que mejor migres todos esos ActiveX a controles para tu proyecto windows forms (que me imagino que es el caso)
Y obviamente es mejor usar los controles de .net que los OCX de antes porque era una lata registrarlos y luego chocaban con las otras versiones..etc..(dll hells), si vas a migrar migralo todo..
Salu2