Problema de permisos con clientes FTP

[Agripado]

Hola anoche tratando de reconfigurar el php para que soporte GD lo hice con el easyapache, pero luego de que lo hizo cargue mi web y me pedia permisos para los archivos y yo dije OH MY GOD!!! la dañé y desde entonces cuando quiero borrar o cambiar los permisos o archivos con algun cliente ftp o incluso con el administrador de ficheros que trae el CPANEL, me dice que no estoy autorizado, o incluso hace la finta de que cambia los permisos y cuando refresco, sigue con los mismos permisos, solo logueandome como root por ssh los puedo cambiar (pero esa no es la gracia, ya que tengo varias cuentas de usuarios), cuando antes con el cute ftp lo hacía sin problemas.

que hice mal? tiene solución?

Muchas gracias por responder

mi server es linux redhat es 3 con cpanel 10 y whm

Mil disculpas si he puesto este mensaje en un foro equivocado.