Hola, pues pones la siguiente funcion entre el <head> y el </head> y luego la llamas cada vez que quieras abrir un popup:
<script language="javascript">
function Abrir(URL, Ventana, Ancho, Alto)
{
var win='';
win=window.open(URL,Ventana, "width="+Ancho+", height="+Alto+", scrollbars=SI, resizable=NO, toolbar=NO")
win.focus();
}
</script>
Por ejemplo:
<a href="javascript
:Abrir('MiPagina.htm','MiPagina',' 500','450')">Abrir MiPagina</a>
Espero te sea util. Bye