tenés que insertar esto en el tag HEAD de la página que se carga en la popup
Código:
<script language="javascript" type="text/javascript">
var segundos = 5;
function cerrar(){
setTimeout("self.close()",segundos * 1000);
}
</script>
(en la variable "segundos" le pones la cant. de segundos que querés que demore en cerrarse!)
y en la misma pag. que se carga en la popup tenes que incluir esto en el tag BODY
Código:
<body onload="cerrar();self.focus()">
se entendió???

suerte!