Creo que más bien se refiere a cambiar la configuración de PHP o personalizarla para la ejecución de un script en concreto ..
Si es así tienes la función:
ini_set()
www.php.net/ini_set
Y el listado de directivas que puedes modificar vía esa función sólo son las que diga "PHP_INI_USER y/o PHP_INI_ALL".
http://www.php.net/manual/en/ini.php#ini.list
Un saludo,