Bueno, aunque no ha tenido mucho exito la consulta pero ya lo he podido hacer, voy a explicar brevemente como lo he hecho por si a alguien le interesa..
posiblemente habra mas posibilidades pero weno...
Lo primero es obtener el nodo padre del que cuelgan las demas tablas.. yo intentaba acceder a la tabla padre, pero no, el nodo padre es la columna <TD> de la tabla principal.
una vez con la columna, recorremos todos los nodos hijos y los vamos copiando en un array.
algo asi.
Código:
var columnaPadre = document.getElementById('columnaPadre');
var nodos = new Array(totalTablas);
//copiamos los nodos a un array
for (var i=0;i<totalTablas;i++)
{
nodos[i] = columnaContactos.childNodes[i].cloneNode(true);
}
hay que tener cuidado porque cada navegador interpreta el arbol dom de forma distinta, por ejemplo en firefox, desde el cual se puede ver el arbol completo, distingue algunos nodos de tipo text aunque esten vacios. Por ejemplo IE no detecta estos nodos.. por lo que habra que tener cuidado y asegurarnos que leemos los nodos <TABLE>, yo por ejemplo, utilizaba una funcion para borrar los nodos de tipo text que hubiera por ahi..
y bueno, ya tenemos los nodos en el array, primero borramos los nodos de la columna, aplicamos el critero correspondiente en el array para cambiarles de sitio y luego los volcamos con appendChild() de nuevo al nodoPadre (la columna).
pues eso es mas o menos.. al final es mas sencillo de lo que parecia..
Saludos.