saludos, creo que el tema que estas buscando es algo como virtual host, con las instrucciones de deny y allow, asi filtras de alguna manera las entradas al ftp, busca documentacion en vsftpd y encontraras lo que buscas...en proftpd si estan esas instrucciones, si te animas a usar proftpd te paso sta guia :
http://www.frikis.org/staticpages/in...p?page=proftpd
checa esto tambien, aunque es para redhat, la configuracion es la misma:
http://www.redhat.com/docs/manuals/e...resources.html
saludos..